1949 -Dňa 6. mája 1949 vyšiel výnos PŠVU v Bratislave pre založenie osobitnej školy v Leviciach, ako prvej školy tohto druhu v okrese. Škola síce bola povolená, ale pre nedostatok miestností sa vyučovanie mohlo - začať až 26.09.1949, a to v suteréne I. Strednej školy v Leviciach. Škola bola dvojtriedna s počtom 35 žiakov. Prvou riaditeľkou bola stanovená Elza Jarošovská, ktorá však vôbec nenastúpila celý školský rok ju zastupovala Mária Topolská, učiteľka školy.
1950 - Začiatky boli veľmi skromné. Školský rok 1950/1951 sa začína v budove II. Národnej školy. Škola tu dostane dve tmavé nevyhovujúce miestnosti, preto sa hľadá riešenie. Vďaka porozumeniu školských činiteľov, škole pridelia 1 miestnosť v budove Živnostenského zväzu. Riaditeľom školy je Štefan Kanyar a neskôr Koloman Šošško. Škole sú pridelené ďalšie miestnosti. Od 1. Septembra 1950 sa vyučovanie začína v novej budove na Tekovskej ulici. Život žiakov sa mení k lepšiemu. Počas ďalších školských rokov sa škola postupne rozrastá, s narastajúcim počtom žiakov sa zvyšuje aj počet tried a pedagógov. Riaditeľmi tohto obdobia sú Alexander Droba, Irena Seemanová a Anton Hadač.
1964 - Významným medzníkom v histórii školy bol školský rok 1964/1965, kedy škola bola presťahovaná na ul. Veľkého Októbra 48 (dnes Sv. Michala 38). Škola má už 7 tried so 94 žiakmi (2 triedy s vyučovacím jazykom maďarským). Riaditeľom školy je naďalej Anton Hadač. 1. Októbra 1964 bol pri OŠ zriadený internát s 5. spálňami a 35. lôžkami.
1976 - Ďalším medzníkom v histórii školy bol rok 1976, kedy OŠI v Leviciach získala štatút detského domova. Od školského roku 1978/79 novým riaditeľom školy je Juraj Štefan. V školskom roku 1982/83 pre zvýšený počet žiakov bola škole pridelená ďalšia budova na ulici Podjavorinskej (pri štadióne), Škola má 18 tried, riaditeľom sa stáva PhDr. adislav Strhársky.
1990 - Riaditeľkou školy od 01.02.1990 je Mgr. Daniela Demová. Veľký prelom v živote OŠI v Leviciach nastáva 01.09.1991. Škola sa sťahuje do nových priestorov, na ul. Zdenka Nejedlého 41. Žiaci spolu so svojimi učiteľmi si tu našli vyhovujúce a kultúrne prostredie.
1993 - Od 01.01.1993 OŠI v Leviciach získava právnu subjektivitu. Od septembra 1996 je zriaďovateľom školy - právneho subjektu Krajský úrad v Nitre.
2000 - 1. septembra 2000 zmena názvu školy: Špeciálna základná škola internátna a Špeciálna materská škola internátna.
2005 – K 30.6.2005 je od školy odčlenený detský domov. 1. 9.2005 vzniká spojením Špeciálnej základnej školy internátnej a Špeciálnej materskej školy internátnej so Základnou školou a Materskou školou pri nemocnici nový subjekt – Spojená škola Levice. Riaditeľkou školy je menovaná Mgr. Daniela Demová.
2011 – Novým riaditeľom školy je menovaný Mgr. Ján Regász. Od 1.septembra 2011 má škola zriadenú ďalšiu organizačnú zložku – Praktickú školu a škola mení názov na Spojená škola internátna, Z. Nejedlého 41, Levice s organizačnými zložkami Špeciálna základná škola s materskou školou internátna, Z. Nejedlého 41, Levice, Základná škola s materskou školou pri zdravotníckom zariadení, Ul. 29. augusta 1, Levice a Praktická škola, Z. Nejedlého 41, Levice